امامزاده سید محمد یکی از معروف ترین و بنام ترین امامزاده های شهرستان فلاورجان می باشد. در شجره نامه به تأیید آقای فلسفی و کتابخانه آستان قدس رضوی موجود در حرم امامزاده چنین آمده است که: سید محمد در قهدریجان استان اصفهان مدفون شده و نسب آن حضرت چنین است: (محمد ابن عیسی ابن موسی ابن ابراهیم ابن موسی ابن جعفرعلیه السلام ) امامزاده چون به روستای زارچان  رسید، دشمنان متوجه شده و ایشان را به شهادت رساندند و حضرتش در زارچان دفن کردند.
این مکان دارای گنبد وبارگاه و گلدسته هایی زیبا می باشد که در نوع معماری شبیه به مناره های زیبای مسجد النبی می باشد. همچنین در حاشیه این مکان نیز تعداد ۲۸ باب زائر سرا جهت اسکان و پذیرایی از زائران و ورفاه حال مسافرین بنا گردیده است.